MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 1673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	GTC	2	6	11	16	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612082
2	NC_017640	TGACAC	2	12	28	39	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386612082
3	NC_017640	AAC	2	6	48	53	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612082
4	NC_017640	GAA	2	6	113	118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612082
5	NC_017640	A	8	8	123	130	100 %	0 %	0 %	0 %	386612082
6	NC_017640	TGGATA	2	12	226	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612082
7	NC_017640	TGGG	2	8	252	259	0 %	25 %	75 %	0 %	386612082
8	NC_017640	TCAT	2	8	262	269	25 %	50 %	0 %	25 %	386612082
9	NC_017640	TTG	2	6	316	321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386612082
10	NC_017640	TG	3	6	334	339	0 %	50 %	50 %	0 %	386612082
11	NC_017640	CTA	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612082
12	NC_017640	AG	3	6	632	637	50 %	0 %	50 %	0 %	386612082
13	NC_017640	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612082
14	NC_017640	ATG	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612082
15	NC_017640	AGTC	2	8	890	897	25 %	25 %	25 %	25 %	386612082
16	NC_017640	AGTG	2	8	1042	1049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017640	CTGT	2	8	1088	1095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017640	AGCTG	2	10	1096	1105	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017640	TA	3	6	1194	1199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017640	TTATG	2	10	1211	1220	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017640	CTG	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017640	ACC	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017640	TA	3	6	1242	1247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017640	GCA	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612083
25	NC_017640	CCCG	2	8	1306	1313	0 %	0 %	25 %	75 %	386612083
26	NC_017640	CCAG	2	8	1401	1408	25 %	0 %	25 %	50 %	386612083
27	NC_017640	GT	3	6	1473	1478	0 %	50 %	50 %	0 %	386612083
28	NC_017640	TCG	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612083
29	NC_017640	ACG	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612083
30	NC_017640	GTG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612083
31	NC_017640	ATC	2	6	1605	1610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612083
32	NC_017640	CGCA	2	8	1691	1698	25 %	0 %	25 %	50 %	386612083
33	NC_017640	CACT	2	8	1852	1859	25 %	25 %	0 %	50 %	386612083
34	NC_017640	CAG	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612083
35	NC_017640	TTC	2	6	1906	1911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612083
36	NC_017640	GC	3	6	2094	2099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017640	TTTG	2	8	2107	2114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017640	ATT	2	6	2125	2130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017640	AGCC	2	8	2184	2191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017640	AG	3	6	2275	2280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017640	ACT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017640	CTG	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017640	ATA	3	9	2420	2428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017640	AT	3	6	2483	2488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017640	ATT	5	15	2517	2531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017640	TAAT	2	8	2556	2563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017640	AT	4	8	2562	2569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017640	AGC	2	6	2574	2579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017640	TCC	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017640	T	6	6	2688	2693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017640	TGC	3	9	2726	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017640	TCT	2	6	2740	2745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017640	AAT	2	6	2836	2841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017640	AGC	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017640	ATT	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017640	A	6	6	2945	2950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017640	CTG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017640	GCA	2	6	3000	3005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017640	ATA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017640	A	6	6	3081	3086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017640	A	7	7	3137	3143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017640	ATT	2	6	3169	3174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017640	AAC	2	6	3199	3204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017640	TCC	2	6	3208	3213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017640	ACC	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017640	CCT	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017640	TTG	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017640	CT	3	6	3400	3405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017640	C	6	6	3449	3454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_017640	GAATG	2	10	3530	3539	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017640	TGT	3	9	3567	3575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017640	CTGA	2	8	3591	3598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017640	ATG	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017640	GTG	2	6	3786	3791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017640	CGC	2	6	3820	3825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017640	AT	3	6	3828	3833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017640	TAT	4	12	3831	3842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017640	AGG	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017640	TA	4	8	3888	3895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017640	A	7	7	3910	3916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017640	T	6	6	3921	3926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017640	TTTA	2	8	3942	3949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017640	C	6	6	3966	3971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_017640	A	6	6	4048	4053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017640	AT	3	6	4062	4067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017640	TAA	2	6	4118	4123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017640	TATT	2	8	4244	4251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017640	TA	3	6	4255	4260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017640	T	6	6	4318	4323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017640	TA	3	6	4364	4369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017640	TA	3	6	4376	4381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017640	G	6	6	4449	4454	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017640	A	6	6	4494	4499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017640	GTG	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017640	TTA	2	6	4514	4519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017640	AAT	2	6	4548	4553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017640	ATT	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017640	AAATG	2	10	4651	4660	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017640	TAT	2	6	4672	4677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017640	A	6	6	4685	4690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017640	GAAAT	2	10	4694	4703	60 %	20 %	20 %	0 %	386612084
102	NC_017640	TAA	2	6	4722	4727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386612084
103	NC_017640	TAT	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612084
104	NC_017640	CAA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386612084
105	NC_017640	TCT	2	6	4779	4784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386612084
106	NC_017640	A	6	6	4810	4815	100 %	0 %	0 %	0 %	386612084
107	NC_017640	CT	3	6	4816	4821	0 %	50 %	0 %	50 %	386612084
108	NC_017640	ATA	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386612084
109	NC_017640	GAA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612084
110	NC_017640	TTA	2	6	4997	5002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612084
111	NC_017640	AT	3	6	5089	5094	50 %	50 %	0 %	0 %	386612084
112	NC_017640	AT	3	6	5098	5103	50 %	50 %	0 %	0 %	386612084
113	NC_017640	GAT	2	6	5131	5136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386612084
114	NC_017640	ACTT	2	8	5144	5151	25 %	50 %	0 %	25 %	386612084
115	NC_017640	TA	3	6	5214	5219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017640	T	6	6	5246	5251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017640	AT	3	6	5273	5278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017640	ATT	2	6	5542	5547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017640	ACC	2	6	5558	5563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017640	ATT	2	6	5628	5633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017640	CAG	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612085
122	NC_017640	CTG	2	6	5775	5780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612085
123	NC_017640	CGC	2	6	5820	5825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612085
124	NC_017640	CAGC	2	8	5933	5940	25 %	0 %	25 %	50 %	386612085
125	NC_017640	CAG	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612085
126	NC_017640	CAGG	2	8	6031	6038	25 %	0 %	50 %	25 %	386612085
127	NC_017640	TG	3	6	6040	6045	0 %	50 %	50 %	0 %	386612085
128	NC_017640	GCC	2	6	6111	6116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612085
129	NC_017640	CA	3	6	6148	6153	50 %	0 %	0 %	50 %	386612085
130	NC_017640	GTG	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386612085
131	NC_017640	CTG	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612085
132	NC_017640	GCTT	2	8	6247	6254	0 %	50 %	25 %	25 %	386612085
133	NC_017640	CGC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386612085
134	NC_017640	GGA	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386612086
135	NC_017640	AGA	2	6	6487	6492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612086
136	NC_017640	CTG	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386612086
137	NC_017640	GCA	2	6	6566	6571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612086
138	NC_017640	T	6	6	6637	6642	0 %	100 %	0 %	0 %	386612086
139	NC_017640	CTGA	2	8	6678	6685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017640	GTT	2	6	6769	6774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017640	GGCTA	2	10	6802	6811	20 %	20 %	40 %	20 %	386612087
142	NC_017640	CAG	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386612087
143	NC_017640	A	6	6	6909	6914	100 %	0 %	0 %	0 %	386612087
144	NC_017640	ATC	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386612087
145	NC_017640	GAA	3	9	6996	7004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612087
146	NC_017640	A	6	6	7003	7008	100 %	0 %	0 %	0 %	386612087
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273	NC_017640	ATTC	2	8	13320	13327	25 %	50 %	0 %	25 %	386612093
274	NC_017640	CGG	2	6	13436	13441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_017640	CAGC	2	8	13462	13469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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277	NC_017640	TCA	2	6	13614	13619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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413	NC_017640	AT	3	6	19906	19911	50 %	50 %	0 %	0 %	386612101
414	NC_017640	TGAT	2	8	19937	19944	25 %	50 %	25 %	0 %	386612101
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421	NC_017640	ATCA	2	8	20177	20184	50 %	25 %	0 %	25 %	386612101
422	NC_017640	TCAG	2	8	20214	20221	25 %	25 %	25 %	25 %	386612101
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424	NC_017640	ATGTT	2	10	20270	20279	20 %	60 %	20 %	0 %	386612102
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432	NC_017640	CAATT	2	10	20597	20606	40 %	40 %	0 %	20 %	386612102
433	NC_017640	TA	3	6	20664	20669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_017640	ACT	2	6	20673	20678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_017640	TGC	2	6	20701	20706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_017640	AGG	2	6	20724	20729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017640	CA	3	6	20789	20794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
438	NC_017640	A	6	6	20796	20801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_017640	CAGGT	2	10	20904	20913	20 %	20 %	40 %	20 %	386612103
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445	NC_017640	A	6	6	21247	21252	100 %	0 %	0 %	0 %	386612103
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486	NC_017640	AAAT	2	8	23754	23761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_017640	GCCC	2	8	24060	24067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
497	NC_017640	CATT	2	8	24121	24128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
498	NC_017640	CTC	2	6	24135	24140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
499	NC_017640	GTC	2	6	24148	24153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_017640	TAT	2	6	24156	24161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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